EN | DE

Dr. Carsten Seyfert

Über

Carsten studierte Molekularbiologie an der Universität Basel. Während seines Masterstudiums war er in der Arbeitsgruppe von Prof. Christoph Dehio in der Abteilung Infektionsbiologie tätig. In dieser Zeit etablierte er eine Nanobody-Expressionsplattform zur Charakterisierung von Bartonella-Effektorproteinen (Beps) und war maßgeblich an der Aufklärung der ersten vollständigen Struktur eines Bep beteiligt. Nach einem Praktikum in der „Cell Line Development and Engineering Group“ bei Octapharma Biopharmaceuticals in Heidelberg begann er im Januar 2020 seine Promotion in der Abteilung Mikrobielle Naturstoffe am HIPS unter der Leitung von Prof. Rolf Müller.

Im Rahmen seiner Promotion erforschte er Biosynthese-Gencluster, die für die Produktion antibakteriell wirksamer Sekundärmetabolite verantwortlich sind. Ziel seiner Arbeit war es, molekulare Mechanismen der Naturstoffbiosynthese aufzuklären und neue Antibiotika durch heterologe Expression zugänglich zu machen. Dabei gelang es ihm, durch struktur- und aktivitätsgeleitete Optimierungsstrategien neuartige Derivate der Antibiotikaklasse der Darobactine zu entwickeln. Diese wurden mittels gezielter genetischer Manipulation sowie durch Optimierung der Produktions- und Aufreinigungsprozesse generiert und umfassend charakterisiert.

Derzeit ist Carsten als Postdoktorand in der Abteilung Mikrobielle Naturstoffe tätig. Er koordiniert biotechnologische Projekte, betreut Doktorandinnen und Doktoranden und ist innerhalb des Darobactin-Teams gemeinsam mit Kolleginnen und Kollegen für die Durchführung von CRO-Studien verantwortlich, um die Antibiotikaklasse der Darobactine weiter zu charakterisieren. Darüber hinaus wirkt er an der Einwerbung von Drittmitteln mit und unterstützt die strategische Entwicklung des IP-Portfolios.


2024

In Vivo Activity Profiling of Biosynthetic Darobactin D22 against Critical Gram-Negative Pathogens

Kany A, Fries F, Seyfert C, Porten C, Deckarm S, Chacón Ortiz M, Dubarry N, Vaddi S, Große M, Bernecker S, …, Herrmann J, Müller R (2024)

ACS Infect. Dis. 10 (12): 4337-4346DOI: 10.1021/acsinfecdis.4c00687

Thermo-amplifier circuit in probiotic E. coli for stringently temperature-controlled release of a novel antibiotic

Dey S, Seyfert C, Fink-Straube C, Kany A, Müller R, Sankaran S (2024)

Journal of biological engineering 18 (1)DOI: 10.1186/s13036-024-00463-y

Harnessing Gram-negative bacteria for novel anti-Gram-negative antibiotics

Birkelbach J, Seyfert C, Walesch S, Müller R (2024)

Microbial Biotechnology 17 (11)DOI: 10.1111/1751-7915.70032

Investigation of the Odilorhabdin Biosynthetic Gene Cluster Using NRPS Engineering

Präve L, Seyfert C, Bozhüyük K, Racine E, Müller R, Bode H (2024)

Angewandte Chemie (International ed. in English)DOI: 10.1002/anie.202406389

2023

Darobactine: eine neue Antibiotikaklasse in Entwicklung

Seyfert C, Porten C, Müller R (2023)

Biospektrum 29 (5): 539-541DOI: 10.1007/s12268-023-1988-6

New Genetically Engineered Derivatives of Antibacterial Darobactins Underpin Their Potential for Antibiotic Development

Seyfert C, Müller A, Walsh D, Birkelbach J, Kany A, Porten C, Yuan B, Krug D, Herrmann J, Marlovits T, Hirsch A, Müller R (2023)

J. Med. Chem.DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c01660

New Genetically Engineered Derivatives of Antibacterial Darobac-tins Underpin their Potential for Antibiotic Development

Seyfert C, Müller A, Walsh D, Birkelbach J, Kany A, Porten C, Yuan B, Krug D, Herrmann J, Marlovits T, Hirsch A, Müller R (2023)

BookDOI: 10.26434/chemrxiv-2023-24tmj

2022

Darobactins Exhibiting Superior Antibiotic Activity by Cryo-EM Structure Guided Biosynthetic Engineering

Seyfert C, Porten C, Yuan B, Deckarm S, Panter F, Bader C, Coetzee J, Deschner F, Tehrani K, Higgins P, …, Herrmann J, Müller R (2022)

Angewandte Chemie (International ed. in English)DOI: 10.1002/anie.202214094

2021

Improved broad-spectrum antibiotics against Gram-negative pathogens via darobactin biosynthetic pathway engineering

Groß S, Panter F, Pogorevc D, Seyfert C, Deckarm S, Bader C, Herrmann J, Müller R (2021)

Chem. Sci. 12 (35): 11882-11893DOI: 10.1039/d1sc02725e